Фамилия образована от церковнославянского мужского имени Агапи́т, которое  берёт начало от греческого «агапитос» – «любимый». РПЦ определяет первоисточник образования имени со значением «возлюбленный» греческого происхождения. 

Фамилия по происхождению является притяжательным прилагательным. Русский фамильный суффикс -ов, означающий отчество либо принадлежность, добавляется к мужским именам или прозвищам, оканчивающимся на твёрдую согласную.

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – АГАПИТОВА.

АГАПИТОВ Алексей Фёдорович.

Жертва политического террора в СССР. Книга памяти Иркутской обл.

Читать по теме:

- См. Библиография. 1.   

- См. Библиография. 2. Стр. 38.

- См. Библиография. 3. Стр. 22.

- См. Происхождение фамилий. 2.1., 2.1.1., 3.1.