Фамилия является продуктом приведения фамильного антропонима на -цкий АПАЦКИЙ к стереотипу фамилий на -ов АПАЦКОВ, и обе фамилии могут восходить к церковнославянским именам Аппия и Ипатий (см. АПАЦКИЙ), что наглядно просматривается на этимологических цепочках их образования: 

АПАЦКОВ < АПАЦКИЙ < Апа < Апия < Аппия;

АПАЦКОВ < АПАЦКИЙ < Апат < Алпат < Алипат < Липат < Липатий < Ипатий.

Такая повторная стандартизация характерна для донского ареала русских фамилий, где стремились привести к единому типу фамильных антропонимов  на -ов фамилии с другими конечными элементами.         

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – АПАЦКОВА.

АПАЦКОВ Василий Тихонович.

Участник Великой Отечественной войны.

Читать по теме:     

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 123.

- См. Библиография. 3. Стр. 121.

- См. Библиография. 4. Стр. 286.

- См. Происхождение фамилий. 2.6., 2.6.1., 2.6.1.2., 4., 4.1., 4.1.11., 4.4., 4.4.15.