Фамилия является фонетическим вариантом фамилии ИЛЬИНЫХ, и обе восходят к церковнославянскому имени Илия (см. ИЛЬНЫХ), что наглядно просматривается на этимологических цепочках их образования: 

ИЛЬЕНЫХ < ИЛЬИНЫХ < Илья < Илия;

ИЛЬЕНЫХ < ИЛЬИНЫХ < ИЛЬИН < Илья < Илия.

Зачастую слог -ин- в фамилиях на -иных выступает в безударном положении, что могло повлечь к смене его на -ен-: безударные и и е звучат почти одинаково, что не отражено в орфографии. Поэтому многие фамилии с конечным элементом -иных обнаруживают фонетических двойников  на -еных.

Фамилии с конечным элементом -их/-ых первоначально появились в северорусских районах, а затем были занесены  переселенцами на Урал и в Сибирь, где они прочно закрепились. Причём настолько прочно, что фамилии в данных регионах могли претерпевать повторную стандартизацию, где стремились привести к единому типу фамилий на -их/-ых фамилии с другими конечными элементами.

В фамилиях на -овых/-евых, ударение никогда не падает на конечный слог, тогда как в фамилиях на -иных оно зачастую на конечном слоге.  И всё же, ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – ИЛЬЕНЫХ. 

ИЛЬЕНЫХ Михаил Фёдорович.    

Кавалер Ордена Славы III степени.

Читать по теме:

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 121.

- См. Библиография. 3. Стр. 118.

- См. Происхождение фамилий. 2.6., 2.6.3., 2.6.3.1., 4., 4.1., 4.1.9.   

ИЛЬЕНЫХ