Фамилия является продуктом приведения фамильного антропонима на -ский МАЛЬСКИЙ к стереотипу фамилий на -ов МАЛЬСКОВ, и обе фамилии могут восходить к церковнославянским именам Мал и Малей (см. МАЛЬСКИЙ), что наглядно просматривается на этимологических цепочках их образования: 

МАЛЬСКОВ < МАЛЬСКИЙ < Мал;  

МАЛЬСКОВ < МАЛЬСКИЙ < Мала < Мал;

МАЛЬСКОВ < МАЛЬСКИЙ < Мал < Малей;  

МАЛЬСКОВ < МАЛЬСКИЙ < Мала < Мал < Малей.

Такая повторная стандартизация характерна для донского ареала русских фамилий, где стремились привести к единому типу фамильных антропонимов  на -ов фамилии с другими конечными элементами.         

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – МАЛЬСКОВА.

МАЛЬСКОВ Илья Григорьевич.

Участник Великой Отечественной войны.

Читать по теме:

 - См. Библиография. 2. Стр. 148, 149.

 - См. Библиография. 4. Стр. 163.

 - См. Библиография. 5. Стр. 72.

- См. Библиография. 6. Часть 3, стр. 183.

 - См. Происхождение фамилий. 2.6., 2.6.1., 2.6.1.2., 3.1., 4., 4.1., 4.1.2., 4.1.8.