Фамилия образована от церковнославянского мужского имени Шафан. Этимология имени библейского персонажа затуманена, возможно, она утрачена.

Фамилия по происхождению является притяжательным прилагательным. Русский фамильный суффикс -ов, означающий отчество либо принадлежность, добавляется к мужским именам или прозвищам, оканчивающимся на твёрдую согласную.  

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – ШАФАНОВА.

ШАФАНОВ Александр Васильевич.                                        

Участник Великой Отечественной войны.

Читать по теме: 

- См. Библия.   4 Цар. 22:3.

- См. Библиография. 9. Стр. 361.

- См. Происхождение фамилий. 2., 2.1., 2.1.1., 3.2.